〔神農本草〕隋志八卷 佚
〔神農本草〕七錄五卷 佚
〔神農本草屬物〕七錄二卷 佚
〔神農採藥經〕七錄二卷 佚
〔雷公藥對〕卷四（舊唐志作二卷）佚
陶弘景曰：藥對四卷，論其佐使相須。（本草經序例）
又曰：雷公桐君更增演本草，二家藥對，廣其主治，繁其類族。（藥總訣序）
〔徐氏（之才）雷公藥對〕新唐志二卷 佚
北齊書本傳略曰：徐之才，字士茂，高平金鄉人也。之才幼而俊發，尤為精敏，仕梁為豫章王綜鎮軍右常侍，隨綜鎮彭城，綜降魏，之才走至呂梁，為魏所獲，既羈旅以醫自業，又諧隱滑稽無方，王公貴人爭饋之，為貴人居矣！稍遷員外散騎常侍，加中軍金紫，天平中，高祖詣晉陽，恆居內館，所療十全，皇建中，除兗州刺史，未行，武明皇後不豫，之才奉藥立愈，賞賜巨萬，有人腳跟腫痛不堪忍，諸醫莫識，之才視曰：蛤精也。當乘舡入海，出腳水中得之，疾者曰：是也。之才為割得兩蛤子，大如榆莢，或以五色骨為佩刀靶，之才曰：此人瘤也。何從得之，對曰：於古塚見髑髏額骨長數寸，試削視文理，故用之，其通識類此。（太平御覽）
掌禹錫曰：藥對，北齊尚書令西陽王徐之才撰，以眾藥名品，君臣佐使，性毒相反，及所主疾病，分類而記之。凡二卷，舊本草多引以為據，其言治病用藥最詳。
李時珍曰：雷公藥對，陶氏前已有此書，吳氏本草所引雷公是也。蓋黃帝時雷公所著，之才增飾之爾。
〔宗氏（令祺）新廣藥對〕藝文略三卷 佚
〔桐君藥錄〕隋志三卷 佚
陶弘景曰：桐君採藥錄，說其花葉形色僧圓至日，桐君山在嚴州，有人採藥，結廬桐木下，指樹為姓，故山得名。
〔子儀本草經〕中經簿一卷 佚
賈公彥曰：劉向云，扁鵲治趙太子，暴疾尸蹶之病，使子明炊湯，子儀脈神，子術案摩，又中經簿云，子儀本草經一卷，儀與義一人也。若然，子儀亦周末時人也。（周禮正義。）
〔蔡氏（邕）本草〕七錄七卷 佚
後漢書本傳略曰：蔡邕，字伯喈，陳留圉人也。少博學，師事太傅胡廣，好辭章數術天文，妙操音律，建寧三年，辟司徒橋玄府，玄甚敬待之，出補河平長，召拜郎中，校書中觀，遷議郎。
〔吳氏（普）本草〕（舊唐志作本草因）七錄六卷 佚
後漢書華佗傳曰：廣陵吳普，彭城樊阿，皆從佗學，普依準佗療，多所全濟，韓保升曰：普，廣陵人也。華佗弟子，撰本草一卷。
掌禹錫曰：吳氏本草，魏廣陵人，吳普撰，吳華佗弟子，修神農本草，成四百四十一種。唐經籍志，尚存六卷，令廣內不複存，惟諸子書多見引據，其說藥性寒溫五味，最為詳悉。
李時珍曰：吳氏本草，其書分記神農黃帝岐伯桐君雷公扁鵲華佗所說性味甚詳，今亦失傳。
〔李氏（當之）本草經〕七錄一卷 佚
韓保升曰：李當之華佗弟子，修神農本經，而世少行用。
〔藥錄〕七錄六卷 佚
李時珍曰：李氏藥錄，其書散見吳氏陶氏本草中，頗有發明。
〔隨氏（費）本草〕七錄九卷 佚
〔秦氏（承祖）本草〕七錄六卷 佚
宋書曰：秦承祖性耿介，專好藝術，於方藥不問貴賤，皆治療之，多所全獲，當時稱之為工手，撰方三十卷，大行於世。（太平御覽）
〔雷氏（ ）炮炙論〕（宋志作炮炙方）藝文略三卷 佚
自序曰：若夫世人使藥，豈知自有君臣，既辨君臣，寧分相製，只如 毛沾溺，立銷斑腫之毒，象膽揮粘，乃知藥有情異，魚插樹，立便乾枯，用狗塗之，卻當榮盛，無名止楚截指，而似去甲毛，聖石開盲明目，而如雲離日，當歸止血破血，頭尾效各不同，蕤子熟生，足睡不眠立據，弊萆淡鹵，如酒沾交，鐵遇神砂，如泥似粉，石經鶴糞，化作塵飛，見橘花，似髓斷弦折，遇鸞血而如初，海竭江枯，投游波而立泛，令鉛拒火，須仗修天，如要形堅，豈忘紫背，留砒住鼎，全賴宗心，唯得芥花，立便成庚，□遇赤須，水留金鼎，水中生火，非猾髓而莫能長齒生牙，賴雄鼠之骨末，發眉墮落，塗半夏而立生，目辟眼□，有五花而自正，腳生肉，棍系菪根，囊皴漩多，夜煎竹木，體寒腹大，全賴顱，血泛經過，飲調瓜子，咳逆數數，酒服熟雄，遍體疹風，冷調生側，腸虛泄痢，須假草零，久渴心煩，宜投竹瀝，除 去塊，全仗消□益食加觴，須煎蘆朴，強筋建骨，酒是蓯，駐色延年，精蒸神錦，知瘡所在，口點陰膠，產後肌浮，甘皮酒服，口瘡舌拆，立愈黃蘇，腦痛欲亡，鼻投硝末，心痛欲死，速覓延胡，如斯百種，是藥之功，某忝遇明時，誤看醫理，雖尋聖法，難可窮微，略陳藥餌之功能，豈溺仙人之要術，其製藥炮熬炙煮，不能記年月哉。欲審原由，須看海集，某不量短見，直錄炮熬煮炙，列藥製方，分為上中下三卷，有二百件名，具陳於後，蘇頌曰：雷 雖隋人，觀其書，乃有言唐以後藥名者，或是後人增損之歟。（証類本草，引圖經滑石注。）
趙希弁曰：雷公炮炙三卷，古宋雷 撰，胡洽重定，述百藥性味炮煮熬炙之方，其論多本之乾寧晏先生，稱內究守國安正公，當是官名，未詳。
李時珍曰：雷公炮炙論，藥凡三百種，為上中下三卷，其性味炮炙煮熬修事之法，多古奧，文亦古質，別是一家，多本於乾寧晏先生，其首序論述物理，亦甚幽玄，錄載於後，乾寧先生名晏封，著製伏草石論六卷，蓋丹石家書也。
按雷 一稱隋人，一稱宋人，未詳何是。然胡洽名見於劉敬叔異苑，彼加其重定，則當為宋人矣！乾寧晏先生製伏草石論六卷，出於新唐志，今以其為道家之書，不著錄焉。
〔陳雷炮炙論〕藝文略三卷 佚
〔王氏（季璞）本草經〕七錄三卷 佚
〔談氏（道術）本草經鈔〕七錄一卷 佚
〔宋大將軍參軍徐氏（叔向）本草病源合藥要鈔〕七錄五卷 佚
南史張邵傳曰：徐秋夫生道度叔向，皆能精其業。
〔四家體療雜病本草要鈔〕七錄十卷 佚
〔王氏（未）鈔小兒用藥本草〕七錄二卷 佚
〔甘氏（浚之）癰疽耳眼本草要鈔〕七錄九卷 佚
〔本草要方〕隋志三卷 佚
〔趙氏（贊）本草經〕七錄一卷 佚
〔亡名氏經略〕隋志一卷 佚
〔本草經類用〕隋志三卷 佚
〔本草經輕行〕七錄一卷 佚
〔本草經利用〕七錄一卷 佚
〔雲麾將軍徐氏（滔）新集藥錄〕七錄四卷 佚
〔亡名氏藥法〕七錄四十二卷 佚
〔藥律〕七錄三卷 佚
〔藥性〕七錄二卷 佚
〔藥對〕七錄二卷 佚
〔藥目〕七錄三卷 佚
〔藥忌〕七錄一卷 佚
〔徐氏（大山）本草〕隋志二卷 佚
〔陶氏（弘景）藥總訣〕（藝文略，作集藥訣，別有藥總訣一卷，似複載。）藝文略一卷 佚
自序曰：上古神農作為本草。凡著三百六十五種，以配一歲，歲有三百六十五日，日生一草，草治一病，上應天文，中應人道，下法地理，調和五味，製成醪醴，以備四氣，為弗服，欲其本立道生者也。當生之時，人心素朴，嗜欲寡少，設有微疾，服之萬全，自此之後，世偽情 澆，智慮日生，馳十無厭，憂患不息，故邪氣數侵，病轉深痼，雖服良藥不愈，其後雷公桐君更增演本草，二家藥對，廣其主治，繁其類族，既世改情移，生病日深，或未有此病，而遂設彼藥，或一藥以治眾疾，或百藥共愈一病，欲以排邪還正，為之原防故也。而三家所列，疾病互有盈縮，或物異而名同，或物同而名異，或冷熱乖違，甘苦背越，採取殊法，出處異所，若此之流，殆難按據，尋其大歸，神農之時，未有文字，至於黃帝，書記乃興，於是神農本草，別為四經，三家之說，遞有損益，豈非隨時適變，殊途同歸者乎。但本草之書，歷代久遠，既靡師受，又無注訓，傳寫之人，遺誤相繼，字義殘闕，莫之是正，方用有驗，布舒合和。（陶貞白文集，○案此非全文，合和以下，尚有數十句。）
掌禹錫曰：藥總訣，梁陶隱居撰，論夫藥品五味寒熱之性，主療疾病，及采蓄時月之法。凡二卷，一本題云藥像口訣，不著撰人名氏，文字並相類。
〔亡名氏藥像口訣〕二卷 佚
〔蔡氏（英）本草經〕隋志四卷 佚
〔亡名氏藥目要用〕隋志二卷 佚
〔姚氏（景）本草音義〕（藝文略作姚最）隋志三卷 佚
〔亡名氏本草集錄〕隋志二卷 佚
〔本草鈔〕隋志四卷 佚
〔本草雜要訣〕隋志一卷 佚
〔依本草錄藥性〕隋志三卷錄一卷 佚
〔原氏（平仲）靈秀本草圖〕隋志一卷（舊唐志作六卷）佚
〔亡名氏入林採藥法〕隋志二卷 佚
〔太常採藥時月〕隋志一卷 佚
〔四時採藥及合目錄〕隋志四卷 佚
〔諸藥要性〕隋志二卷 佚
〔種植藥法〕隋志一卷 佚
〔李氏（密）藥錄〕隋志二卷 佚
北史李裔傳曰：密字希邕，少有節操，母患積年，名醫療之不愈，乃精習經方，洞閑針藥，母疾得除，由是以醫術知名，屬爾朱兆弒逆，與勃海高昂，為報複計，後從神武，封容城縣侯，位襄州刺史。
〔甄氏（闕名）本草〕隋志三卷 佚
〔甄氏（立言）本草音義〕（新唐志注曰：立言一作權。）隋志七卷 佚
舊唐書甄權傳曰：權弟立言，武德中，累遷太常丞，御史大夫，杜淹患風毒發腫，太宗令立言視之，既而奏曰：從今十一日午時必死，果如其言，時有尼明律，年六十餘，患心腹鼓脹身體羸瘦，已經二年，立言診脈曰：其腹內有蟲，當是誤食發為之耳，因令服雄黃，須臾吐出一蛇，如人手小指，唯無眼，燒之猶有發氣，其疾乃愈，立言尋卒，撰本草音義七卷，古今錄驗方五十卷。
〔本草藥性〕舊唐志三卷 佚
〔亡名氏藥性論〕宋志四卷 佚
掌禹錫曰：不著撰人名氏，集眾藥品類，分其性味君臣主病之效。凡四卷，一本題曰陶隱居撰。然所記藥性功狀，與本草有相戾者，疑非隱居所為。
李時珍曰：藥性論，即藥性本草，乃唐甄權所著也。權 扶溝人，仕隋為秘書省正字。唐太宗時，年百二十歲，帝幸其第，訪以藥性，因上此書，授朝散大夫，其言論主治亦詳。
按隋志所載甄氏本草，與立言本草藥性，疑是同書，若藥性論，亦豈一書歟，唯卷帙不同，至李時珍說，恐難信據。
〔沙門行矩諸藥異名〕（新唐志，作僧行智。）隋志八卷，注曰：本十卷今闕 佚
〔王氏（方慶）新本草〕新唐志四十一卷 佚
舊唐書本傳曰：王方慶，太原人也。雅有材度，博學多聞，篤好經方，精於藥性，則天令監領尚藥奉御張文仲侍醫李虔縱光祿韋慈藏等，撰諸藥方，方慶撰隨身左右百發百中備急方十卷，大行於世。
〔藥性要訣〕新唐志五卷 佚
〔鄭氏（虔）胡本草〕新唐志七卷 佚
新唐書本傳曰：鄭虔，鄭州滎陽人，天寶初，為協律郎，集掇常世事，著書八十餘篇，有窺其稿者，上書告撰私撰國史，虔蒼黃焚之，坐謫十年還京師，玄宗愛其才，欲置左右，以不事事更置廣文館，以虔為博士，虔不知廣文曹司何在，訴宰相曰：上增國學，置廣文館，以居賢者，令後世廣博文士自君始，不亦美乎。虔乃就職之久雨壞廡舍，有司不複修完，寓治國子館，自是遂廢，初虔追故書可志者，得四十餘篇，國子司業蘇源明名其書為會粹，虔善圖山水，好書，常苦無紙，於是慈恩寺貯柿葉數屋，遂往日取葉肄書，歲久殆遍，嘗自寫其詩，並書以獻，帝大署其尾曰：鄭虔三絕，遷著作郎，安祿山反，遣張通儒劫百官，置東都，偽授虔水部郎中，因稱風緩，求攝市令，潛以密章達靈武，賊平與張通王維並囚宣陽裡三人者，皆善書畫，崔圓使繪齋壁，虔等方悸死，即極思析解於圓，遂免死，貶台州司戶參軍事，後數年卒。
〔蕭氏（炳）四聲本草〕宋志四卷 佚
掌禹錫曰：四聲本草。唐蘭陵處士蕭炳撰，取本草藥名每上一字，以四聲相從，以便討檢。凡五卷，前進士王收撰序。
〔江氏（承宗）刪繁藥詠〕新唐志三卷注曰鳳翔節度要籍 佚
〔楊氏（損之）刪繁本草〕藝文略五卷 佚
掌禹錫曰：刪繁本草。唐潤州醫博士兼節度隨軍楊損之撰，以本草諸書所載，藥類頗繁，難於看檢，刪去其不急，並有名未用之類，為五卷，不著年代，疑開元後人。
〔杜氏（善方）本草性類〕藝文略一卷 佚
掌禹錫曰：本草性事類，京兆醫工杜善方撰，不詳何代人，以本草藥名，隨類解釋，刪去重複，又附以諸藥製使畏惡解毒相反相宜者為一類，共一卷。
〔亡名氏南海藥譜〕藝文略七卷（宋志作一卷）佚
掌禹錫曰：南海藥譜，不著撰人名氏，雜記南方藥，所產郡縣及療疾之驗無倫次，似唐末人所作。凡二卷。
〔李氏（ ）海藥本草〕藝文略六卷 佚
李時珍曰：海藥本草，即南海藥譜也。凡六卷。唐人李 所著，蓋肅代時人，收采海藥，亦頗詳明。
按南海藥譜，與海藥本草，其目各見於崇文總目，不知李時珍何據為一，其言殆難信焉。
〔張氏（文懿）本草括要詩〕宋志三卷 佚
玉海曰：後蜀張文懿撰本草括要詩三卷。
〔日華子諸家本草〕二十卷 佚
掌禹錫曰：日華子諸家本草，國初開寶中四明人，撰不著姓氏，但云日華子大明，序集諸家本草近世所用藥，各以寒溫性味，華實蟲獸為類，其言近用，功狀甚悉。凡二十卷。
李時珍曰：按十家姓，大姓出東萊，日華子蓋姓大名明也。或云其姓田，未審然否。
〔亡名氏本草韻略〕藝文略五卷 佚
〔藥林〕藝文略一卷 佚
〔梁氏（嘉慶）本草要訣〕藝文略一卷 佚
〔亡名氏採藥論〕藝文略一卷 佚
〔製藥論法〕宋志一卷 佚
〔裴氏（宗元）藥詮總辨〕宋志三卷 佚
〔許氏（洪）太平惠民和劑局方藥石炮製總論〕一卷 存
〔胡氏（仕可）本草歌括〕國史經籍志八卷（醫藏目錄作二卷）未見
自序曰：本草，即儒家之史書是也。儒不讀諸史，何以知人才賢否，得失興亡，醫不讀本草，何以知名德性味，養生延年，照本草之名書，自神農本經，以至名醫別錄。唐本蜀本，新定重定，先附今附之數，不下一千七百餘條，其論性體之溫涼，功用之緩急，自有六十 其於國小，未易涉獵，仆 承敕命，掌教瑞陽，思欲便於國小，擇其見於用者自博而為依，按本文葉韻成類，庶幾讀者易記，亦可知其大略，用鋟諸梓，與同志共之，時元貞改元九月朔旦，宜豐可丹胡仕可序。
〔何氏（士信）補注本草歌括〕八卷 存
〔熊氏（宗立）增補本草歌括〕八卷 存