凡例
一、素問古目八十一篇，除亡刺法、本病兩篇，實共七十九篇，其中論陰陽、脈象、治法者五十一篇，論針灸、穴俞者二十二篇，論歲運、六氣者七篇。雖皆軒岐數聖人闡發救人妙義之所在，然其間有理數之分。陰陽、治法者理也，理本變化無方；針灸、歲運者數也，數則有象可擬。故特分為內外篇，庶使讀是經者，于神理所在，精思而熟玩；象數所在，則僅記憶焉可也。
- 宋新校正言，漢藝文志雲黃帝內經素問九卷，至隋經籍志雲止存八卷，全元起注本亦云少第七卷，王太仆序素問言第七卷師氏藏之，即歲運天元紀等七篇也。新校正疑其篇卷浩大，以為別是陰陽大論之文，王氏特借以補所亡之卷，引張仲景傷寒論序為証，庸或有之。但素問一書，凡天地所有，無一不備，七篇雖獨浩大，然暢論陰陽變化自應如是，書經亦出於壁，太仆之語豈即誣也。
- 素問文義雖經王氏注解，高保衡等校正，各雲備極苦心矣，然錯誤脫漏處仍多。茲各于本篇條下，辨駁其是非，參考其得失，非敢訾議前賢，良以經旨不可冒昧，人命非同草菅，寧負狂妄之罪耳。至於管窺之見，疵自多，削而去之，是所望於後之君子。
- 太仆之注至真要大論也，“壯水之主以製陽光，益火之原以消陰翳”二語，闡前聖所未發，開後學之顓蒙，卓然千古，是注也而經矣。自余未盡合處，瑜不掩瑕，無失其為至文。
- 每篇各有命名之義，有為篇中要旨所關者，有毫無關涉，不過以起首有此數字而即以之為名者。又一篇之中，問答條款逐段不同。若非並為標出以提其綱，觀者能無眩亂。茲特總序名目於篇首，如詩之有小序也。
- 篇中問答一項為一段，分注於其下，井然不亂，庶幾心目了然。又其文氣高古，句法錯落，有一、二字為一句者，有十數字為一句者。茲于語氣略斷處讀（音逗）
之，讀之音韻婉轉而義理愈出，是乃所謂章句也。
- 是經去古既遠，殘缺自多。王注每曲為之解而理愈晦，即甲乙經、全元起注本以至新校正亦多未確。茲不敢傅會，寧闕疑焉。
- 古本每篇舊有次敘數目，今既分為內外篇，已無次序，用何數目，故並去之。
- 訓詁大家惟以詮釋本文而已，醫經則獨不可。蓋問答之意，不過偶舉一端，原非脈病之全旨，後人執而泥之必偏矣。王注類多隨文順釋。拙解則必會通大意而後詮釋本文，或注明本文而後補出全旨，使觀者融會心胸，庶不致有偏泥之害也。
- 內篇所載，皆陰陽變化之大義，脈象治法之要旨，固當細心體認。至於外篇，針灸如離合真邪等篇，歲運如至真要天元紀等篇，其中各有精義，所當節取以究其微，未可以其列之外篇而概視為膚淺也。
- 熱論篇仲景之所祖之以為傷寒論者，字字皆有著落，段段各有精義。向閱王注，頗下恰意，方思有以易之而未能。後見烏程閔氏芝慶者集中，特為此篇作注，最為明確，無以易也，故全錄之。惜乎此君不為素靈全經作注，誠憾事耳。
- 歲運七篇中有天文度數及天符歲會等義，實余素所不解者，王注既不快意，杜撰又非所能，閣筆者久之。後得景岳張公類經注解，推算詳明，確然可遵，竟全錄之，間有不合處，乃附謹按於其下。茲集實賴二公之玉吾成也。
- 末後著至教等七篇，文辭意旨與全經絕不相類，的系後人假托以充篇目之數者。王氏一概混為之注而不能辨，直為其人所欺矣。自今道破，後之君子諒不以吾言為孟浪也。
- 是集或有謂余當全載原文，但于應節解處各記鉤勒，庶使讀者備悉源流，知經之所以節，注之所以另為解，是也。但此舉原所以便肄習，苦仍列全文，則不特篇卷浩繁，且使讀者心目眩亂，故予節略，非但省文，實所以豁心目也。
- 素問古目九卷，王氏分為二十四卷，未免太繁，今分內篇三卷，外篇六卷，合為九卷，仍古目也。